昭和２３年ごろの戦後の混乱期，学制の改革によって萩中学校から萩高等学校に変わるとき，新校章が必要となり、全生徒より校章の図案を募集，４５０点の応募の中から適当と思われる一つが選出された。　　　　　

　その時の図案は，旧萩中学校の校章の「はぎ《と「桜《の花を抱き合わせたものをかたどったもので、外形は正三角形であった。しかし，当時美術担当の先生らの意見で外形を三つの円弧で囲む三角型とした。これは正三角形であると鋭く，冷たい感じがするため変えたもので，三つの円弧は平和，円滑，温かさ等を象徴している。それから「桜《の花は除いて「はぎ《の花だけにした。このようにして，この校章ができた。

　　The kanji “高” is surrounded by leaves, which shape a triangle.  Each arc of the triangle symbolizes “peace”, “smooth”, and “warmth” . 

　本校が位置する萩の三角州をモチーフにし、Ｈａｇｉ　Ｈｉｇｈ　Ｓｃｈｏｏｌの「Ｈ《で構成しています。本校がめざす学校像「学力向上・進路実現・地域連携《を実現しようとする想いが込められています。

  　Hagi City has two main rivers; Matsumoto River and Hashimoto River.  The two 　curved lines in the symbol stand for these two rivers, and the circle, our school.  This 　also shows the location of our school.  It expresses our hope for “improvement in academic ability”, “realization of students’ careers”, and “cooperation with the community”.